1月
3日，為配合“國防部”“全募兵制”的推行，“國防部”軍備局工程營產中心規劃組長唐治平上校表示，臺軍將持續改善官兵生活設施，藉由兵舍建筑標準化、模塊化、人性化的規劃理念，將可提升官兵居住質量，有效提升臺軍官兵生活設施，吸引高素質人才加入臺軍。
4日，為塑造全民“無煙”環境，“國防部”重申，自11日“煙害防治法修正條文”正式實施，各單位只要是3人以上的室內工作場所，就必須全面禁煙，違者則將處以1萬以上到5萬以下的罰款。
5日，“國防部長”陳肇敏視導人事參謀次長室時強調，對于臺軍人員的招募與考核工作，必須堅持嚴謹、公平、公正及客觀的態度，以德才兼備、德重于才、質重于量的方式進行舉薦與晉用，舉薦不實者也必須承擔起相關的責任。
5日，“空軍司令”彭勝竹與空軍官校校長唐齊中少將共同主持“臺軍空勤人員求生訓練中心”揭牌典禮。
7日，“國防部長”陳肇敏視導通信電子信息與作戰暨計劃參謀次長室兩個單位，強調臺軍的建軍備戰工作不可松懈，必須強化各項作戰訓練作為與反制能力，同時配合“政府”兩岸政策，在軍事安全優先考慮下，完成三軍戰備整備任務。
7日，針對“兩岸軍事互信機制與中共撤除東南沿海部分飛彈陣地釋出善意”一事，“國防部長”陳肇敏表示，臺軍將配合“政府”相關政策，并依“國防部”相關因應計劃，按遠、中、近程規劃執行，未來并依兩岸發展情況，進行研議與修正。
8日，為落實馬英九所宣示，臺軍不因兩岸關系的改善而松懈備戰，以及有效提升臺軍官兵心防，臺“國防部”制訂頒布“正義項目”，藉由法令倡導，強化官兵敵情觀念，確保臺軍內部純凈。
12日，陳水扁控告“國防部長”陳肇敏加重誹謗案，一審時判決陳“部長”無罪，陳水扁提出上訴，臺灣高等法院今日二審宣判，全案上訴駁回，陳肇敏無罪定讞。
13日，軍事記者團參訪陸軍春節戰備巡弋活動，戰、炮車伴隨地面部隊官兵，進行反特攻作戰操演，展現官兵協同作戰能力。
15日，臺軍方媒體披露，陸軍步兵學校“T91步槍射擊訓練仿真器”歷經多年來的使用評估后，已建立起完整的訓練和教學能量，經由此一經驗證實可大幅提升輕兵器射擊訓練成效，因此透過陸軍教準部的協助，陸軍將以“陸軍2009年輕兵器射擊仿真器擴建案”，全面推廣并建置T91步槍射擊訓練仿真器，完成后將對陸軍的戰力有明顯的提升。
18日，“國防部長”陳肇敏前往南沙太平島，代表馬英九、劉兆玄慰問駐防官兵。
18日，臺軍方媒體披露，為提升憲兵摩托車連機動打擊戰力，憲兵摩托車連今年正式換裝新型1300CC重型摩托車，讓憲兵在執行任務時能有效發揮機動性，達成具快速打擊實力的現代化部隊目標。
18日，臺軍方媒體披露，為精進教育訓練、提升臺軍官兵體能，“國防部”已研擬完成“臺軍體能訓測實施計劃”，采循序漸進訓練，希望使臺軍人員養成運動習性，鍛煉強健體魄，進而強化部隊整體戰力。
19日，“國防部”軍事發言人室表示，國軍向來重視“反毒工作”，“國防部”每年均擴大反毒文宣作為，運用臺軍報刊及電子媒體，制作反毒系列專輯，加深官兵認知，杜絕毒品危害。
21日，“國防部”軍事發言人室表示，“陸海空軍懲罰法”部分條文修正案于今日公布，修正條文將從2009年1月23日起正式施行，臺軍懲罰將有重大變革，原來采用“刑先懲后”的程序將改為“刑懲并行”的程序。
24日，臺軍三軍儀隊恢復中正紀念堂禮兵勤務。
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