官員表示，今早報紙上的報道是引用大陸商務部的研究報告，和臺灣“中經院”的評估報告，這兩個報告據他所知，都是采用“可計算的一般均衡模型 (CGE模型)”所得出的結果，這些評估模型是就某些假設條件給予參數，經由模型運算后，得出一些數字，只要參數不同，其結果就不同。
官員說，參數是人為給予的，是先假設未來的狀況應該是如何，因此給出一些參數，這些參數影響了最后的結果，但這些參數卻可能與未來的情況截然不同。
他表示，模型得出的結果中，其顯現的方向，如正向或負向，較有指標的意義，但其顯現的數字大小，不具太大意義。
至于兩份報告得出對于GDP的貢獻，報道經由雙方的經濟規模計算得，得出大陸每年可以獲利270億美元，臺灣只能獲利69億美元，指出大陸在簽署后獲利較大。
官員認為，這可以打個比方，大陸的經濟規模是臺灣的11倍，就像王永慶的企業與一般雜貨店相比，雜貨店一天賺個5000塊錢、1萬塊錢，就很高興了，但王永慶的企業可能一天賺500萬或5000萬都嫌太少。
他表示，如果用經濟規模看，顯然大陸要比臺灣多賺11倍，對他們才算是劃算的，但實際上不可能如此，就此而言，就算大陸絕對數值賺得比臺灣多，但以考慮經濟規模，實際上是臺灣比較占便宜。
臺當局“經濟部”表示，目前兩岸已各自透過學術機構提出個別研究報告，均顯示兩岸洽簽經濟合作架構協議具有正面與實質的經濟效益，并對于推動的方向及看法歧異不大。
