福建省科協主動融入國臺辦、省政府主辦的第1屆至第4屆海峽論壇，舉辦海峽兩岸科技社團合作與發展交流會，承辦海峽科技專家論壇，共邀請臺灣100多個機構、800多位專家學者和大陸20多個省區市科協、1200多位專家學者參加。引進并簽約“安全云計算戰略合作備忘錄”、“戴云山蝴蝶種類資源專項調查研究”等兩岸科技合作項目16項，洽談合作意向項目50多項。

　　2007年以來，舉辦海峽兩岸大學生辯論賽5屆，臺灣和大陸共80支高校代表隊、600多名大學生參賽；舉辦海峽兩岸科技與經濟論壇5屆、海峽兩岸管理科學論壇5屆、海峽兩岸科普論壇6屆，共邀請臺灣專家學者1000多名、大陸各地專家學者1300多名參加，交流論文1100多篇，舉辦地點涵蓋10多個兩岸城市。海峽兩岸大學生辯論賽已由省科協項目升格為中國科協、國臺辦支持的項目，“一賽三論壇”由在大陸舉辦擴大到兩岸輪番舉辦，由區域性賽事、論壇升格為全國性賽事、論壇。

　　發揮閩臺“五緣”優勢，積極開展多層次、多渠道的閩臺科技交流，融洽同胞感情，厚植閩臺情緣。全省科協系統共接待臺灣學者和青年學生516批、7079人次來閩考察交流，組織303批、4503人次我省專家學者赴臺考察交流，舉辦“海峽兩岸科普嘉年華”、“閩臺青少年科技教育論壇”、“海峽兩岸地質災害防治學術研討會” 、“海峽兩岸青年科學家信息化論壇”等活動。